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在天河二号的辅助下,科学小组筛选出的某药物与冠状病毒蛋白质的模拟结合模型。

平安是对社会最大的贡献

为打赢疫情防控人民战争、总体战、阻击战提供有力的科技支持;

的开局,突然的新冠肺炎疫情席卷全国,给人民的生命安全和经济社会的快速发展带来了严峻的考验。 在这场不能打败的战争中,广州的科技力量很精锐。 在国家超算广州中心,天河二号超计算机以每秒最高10亿次的超强计算力,筛选出能够抑制病毒的小分子药物,建立15秒诊断的新冠肺炎ct影像智能诊断平台,建立新冠肺炎患者时空轨迹数据库,依靠大国重器的力量,

重器下面还有人。 大年初9,广州智和医药科技有限企业首席执行官谢伟东博士乘坐空摇摆的飞机从加拿大返回广州。 届时,智和医药通过天河二号从数千种上市药物中筛选出30种潜在药物。 但是,战斗没有结束。 他必须借助超计算和人工智能算法的力量,从数亿种化合物中继续寻找对新型冠状病毒有特效的星星。

人类与疾病作斗争的最有力的武器是科学技术。 广州的超算,全面融入疫情防控主战场,彰显了国家宝藏的力量和担当。

文,图/广州日报所有媒体记者方晴通讯员莫倩

寻找药物:两三天内选出30种潜在药物

年八,在搭乘飞往加拿大的飞机之前,谢伟东从合作伙伴广州呼吸疾病研究处久闻新型冠状病毒引发肺炎疫情的严重性。 多年从事分子生物学研究和药物筛选研究的他很快认识到,对于没有特效药的未知病毒,旧药的新使用是最快、最安全的。 筛选比较有效的旧药是他的强项!

作为将人工智能应用于新药挖掘的公司,智和医药自主开发了深度学习算法系统,过去一年半来,该企业一直利用广州超算中心天河二号超级计算机开展化合物筛选、药物挖掘。

谢伟东说,用算法筛选药物的原理是比较病毒结构的特定靶点,将药物化合物结构输入系统,与靶点对接,用多项指标评价其对接情况,表明结合越好,药物化合物的效果越好

为什么要用超算? 由于蛋白质结晶是许多复杂的结构,在虚拟小分子中寻找其活性位需要数百万次的尝试。 以普通计算机的计算能力,从所有上市药物中筛选出比较有效的药物,需要2~3个月。 按照天河二号的计算力,只需要两三天。 在这个过程中,超计算、大数据、人工智能是不可缺少的。

年初二( 1月26日),上海科技大学饶子和/杨海涛课题组公布了测定的2019-ncov冠状病毒3cl水解酶( mpro )的高分率晶体结构。

当天,智和医药研究小组立即与广州超计算中心科研团队联动,启动星光超计算应用服务平台上自主开发的集合前基于统计、高通量计算和最新ai方法的药物筛选软件平台,天河二号

2、3天内,包括至今未报道的6种药物在内的30种潜在药物迅速定位。 小组将把这些结果全部公布在网上,由科研机构免费录用。

为了方便其他科研团队的后续研究,谢伟东立即联系了全球多家药物供应商,花了两周的时间,完成了所有潜在药物化合物的购买,并免费提供给下一个团队开展了病毒抑制试验。 药效目前还在进一步验证中。

疫情暴发后,我相信全世界的科学家们都在做三件事来治疗新冠引起的肺炎。 新药的开发,旧药的新使用,疫苗的开发。 这是作为科学家的责任。 谢伟东说,我年初9从加拿大回来的时候,所有人都不要回来,飞机差不多是空。 但是,我一定会回来。 这是战斗,我们没有责任。

制药:目前正在筛选化合物

但是特效药还没有诞生,战斗还没有结束。 谢伟东告诉记者,智和医药依靠聚集近1亿个化合物的3d结构数据库,在天河二号超级计算机上开展化合物发掘。 目前正在筛选几种化合物,购买完毕后将与p3实验室联合进行病毒抑制实验。 但是新药的开发并不容易,需要严格多复杂的步骤和大量的投入,最快也需要2~3年。

幸运的是,人类现在拥有超计算、人工智能、大数据等科学技术力量,正在缩短新药开发的时间。 谢伟东说,我是广州人,是中大人。 我很自豪。 有广州、大阪、天河二号这样的超级计算机。 在这场瘟疫中,它是科学家手中有力的武器。

分解:定点医院疗效数据在线分解

疫情防控也离不开大数据测算和助力。 目前,广州超算正在助力全国疫情。

昨天,超算中心负责人向记者介绍,通过国家卫健委及其所属单位的合作,超算中心部署了国务院医疗救助组新冠的肺炎病例医疗质量管理体系。 我们利用现有健康医疗平台的特点基础,紧急研发,引入基于超算的抗新型冠状病毒疫情新闻系统和数据库,实现定点医院所有病例数据和临床药物疗效数据的实时采集和在线分解,实现抗疫情医疗质量的控制和分解

在阻断疫情扩散方面,广州超算中心也发挥了重要意义。 该负责人表示,从大年30日起,广州超算中心科研团队参与了疫情防控软件的研发工作。 该软件基于确诊患者,利用先前流传的流行病调查和大数据跟踪分解等手段,结合地理新闻技术,建立了新型冠状病毒肺炎患者时空轨迹数据库。

软件可以每5-10分钟收集客户轨迹数据,反馈至广州超算中心,通过中心强大的计算后台,定期进行客户数据和确诊患者的数据空的匹配度 可以实时判断和反馈客户的感染风险,同时提醒客户自我隔离,或者积极阻断就医。

诊断:对可疑区域进行注释,辅助正确诊断

记者了解到,除辅助药物筛选、疫情弹药开发外,超算中心还与中山大学附属医院合作,紧急开发新型冠状病毒肺炎ct影像智能诊断平台。

之所以紧急开发,是因为这个平台是拿来急救的。 超计算中心负责人昨天告诉记者,疫情初期全国疑似病例迅速增加,湖北省情况尤为严重。 但是,一名专科医生每天只能诊断70多名患者,在疫情严重的灾区远远不够。

为此,在获得第一手新型冠状病毒感染ct影像数据后,广州超计算中心紧急组织医学影像智能诊断小组,与中山大学附属医院的专科医生合作,在短短一天内开发出初步的诊断模型,导入超计算平台进行模型的调整和测试优化

据悉,该平台检测精度高,平均15秒钟即可完成一名患者的ct影像诊断。 医生只需要将患者的ct图像统一封装在平台上,就可以在短时间内获得所有图像的智能诊断结果,平台会显示ct图像中的可疑区域,帮助医生进行准确的诊断。

天河2号:疫情发生前是医疗老手

在这场疫情中,广州超算为什么被信任? 实力。 据说广州超算中心天河二号超级计算机获得了世界超算五百强的六连冠。 在广东、广州市政府的支持下,广州超算已成为全球最广、客户最多的超算中心之一,在全球超算域名城排名第五,是我国唯一进入该排名前十的超算中心。

该负责人告诉记者,生物医药、健康医疗行业是广州超计算中心历来发展迅速的应用行业,中心在该行业投入了大量的资源、人才队伍开展应用研究和客户合作,取得了显著的应用效果。

例如,我们和国家卫健委下属的基准医学中心是长时间的合作机构。 疫情之前,我们已经拥有优秀的应用基础、完全可靠的硬件基础和软件环境、业务熟练的人才队伍,可以迅速开展疫情防控相关工作,在短时间内取得较好成果。

标题:“15秒完成一次CT图像诊断 “天河二号”超级计算机搭建CT影像智能诊断平台”

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